Calcolo R0 o Rt - Monitoraggio situazione in tempo reale

Analisi preliminare sui dati

Gli algoritmi utilizzati sono spiegati da Kevin Systrom qui. Per la mia ricerca ho adattato i suoi algoritmi, ai dati forniti dalla Protezione Civile e generato dei grafici per la situazione italiana dell'indice di contagio

Premessa sulla ricerca di R0 o Rt

tratto da Kevin Systrom 12 Aprile 2020

In ogni epidemia, 𝑅𝑡 è la misura nota come numero di riproduzione efficace. È il numero di persone che si infettano per ogni persona infetta alla volta 𝑡.
La versione più nota di questo numero è il numero di riproduzione di base: 𝑅0 quando 𝑡 = 0. Tuttavia, 𝑅0 è una singola misura che non si adatta ai cambiamenti nel comportamento e nelle restrizioni.


Man mano che una pandemia si evolve, le crescenti restrizioni (o il potenziale rilascio di restrizioni) cambiano 𝑅𝑡. Conoscere l'attuale 𝑅𝑡 è essenziale. Quando 𝑅> 1, la pandemia si diffonderà in tutta la popolazione.
Se 𝑅𝑡 <1, la pandemia crescerà fino a un numero fisso inferiore alla popolazione. Più è basso, più è gestibile la situazione. Il valore di 𝑅𝑡 ci aiuta (1) a comprendere l'efficacia delle nostre misure di controllo di un focolaio e (2) ci fornisce informazioni vitali sull'opportunità di aumentare o ridurre le restrizioni basate sui nostri obiettivi concorrenti di prosperità economica e sicurezza umana. Epidemiologi molto rispettati sostengono che il monitoraggio 𝑅𝑡 è l'unico modo per gestire questa crisi.


Tuttavia, oggi, per quanto ne so, non esiste un monitoraggio in tempo reale di 𝑅𝑡 in Italia. In effetti, l'unica misura in tempo reale che ho visto è stata per Hong Kong.
Ancora più importante, non è utile comprendere 𝑅𝑡 a livello nazionale. Invece, per gestire efficacemente questa crisi, abbiamo bisogno di una granularità a livello locale (provincia/città) di 𝑅𝑡.

Il caso Italia
[Sardegna, Lombardia e Piemonte]


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